Puede ser que cuando instalemos Emerald, y pongamos un tema de susodicho programa, no cambie nada en absoluto, para solucionarlo,
haremos esto:

En Administrador de Opciones Compiz, en el plugin Window Decoration (o Decorado de Ventanas) cambiar lo escrito en el apartado Command por esta línea:

    /usr/bin/emerald --replace

Reiniciamos y ya podremos tener nuestro escritorio así: